Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L2Q9P2F8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L2Q9P2F8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L2Q9P2F8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L2Q9P2F8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L2Q9P2F8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L2Q9P2F8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L2Q9P2F8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIPA1L2Q9P2F8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms