Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH10Q9P2E7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH10Q9P2E7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms