Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTGFRNQ9P2B2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms