Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SH3BP4Q9P0V3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP4Q9P0V3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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