Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDP1Q9P0J1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms