Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDE1Q9NZC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDE1Q9NZC3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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