Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms