Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM161AQ9NX61 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms