Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ASF1BQ9NVP2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ASF1BQ9NVP2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms