Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTG1Q9NSN8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms