Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC6A13Q9NSD5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC6A13Q9NSD5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms