Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMC2Q9NRP2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMC2Q9NRP2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms