Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TLR8Q9NR97 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TLR8Q9NR97 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TLR8Q9NR97 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TLR8Q9NR97 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLR8Q9NR97 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLR8Q9NR97 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TLR8Q9NR97 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms