Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCRT2Q9NQ03 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms