Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRC4Q9NPP4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms