Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41L4AQ9HCS5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L4AQ9HCS5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms