Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHX3Q9H6B9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHX3Q9H6B9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms