Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC90BQ9GZT6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms