Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf27Q9GZN8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf27Q9GZN8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms