Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CEP44Q9C0F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CEP44Q9C0F1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms