Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2OQ9C0C9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2OQ9C0C9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms