Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP1Q9C000 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 701.5 ms