Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EDEM3Q9BZQ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDEM3Q9BZQ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms