Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms