Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PCGF6Q9BYE7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PCGF6Q9BYE7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PCGF6Q9BYE7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms