Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms