Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOL6Q9BWW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL6Q9BWW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms