Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB2BQ9BVA1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms