Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms