Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDFIP1Q9BT67 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms