Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HDHD3Q9BSH5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDHD3Q9BSH5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms