Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC22CQ9BRL7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC22CQ9BRL7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms