Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EBF4Q9BQW3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBF4Q9BQW3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBF4Q9BQW3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBF4Q9BQW3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBF4Q9BQW3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBF4Q9BQW3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBF4Q9BQW3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms