Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP1Q99575 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP1Q99575 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POP1Q99575 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POP1Q99575 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POP1Q99575 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POP1Q99575 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POP1Q99575 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms