Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EYA3Q99504 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EYA3Q99504 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms