Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAB3IPQ96QF0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3IPQ96QF0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms