Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMG1Q96Q15 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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