Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRNT1Q96Q11 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRNT1Q96Q11 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms