Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YPEL4Q96NS1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms