Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf49Q96NF6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms