Protein–RNA interactions for Protein: Q96M98

PACRG, Parkin coregulated gene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGQ96M98 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACRGQ96M98 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms