Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC42Q96M95 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC42Q96M95 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms