Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC7Q96M83 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC7Q96M83 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms