Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms