Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOLD1Q96LR9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms