Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT74Q96LB3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT74Q96LB3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms