Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP47Q96K76 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP47Q96K76 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms