Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PGBD1Q96JS3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGBD1Q96JS3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms