Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms