Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC136Q96JN2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms